ANÁLISES MORFOMÉTRICA E MOLECULAR DE ISOLADOS DE PRATYLENCHUS COFFEAEOCORRENTES NO ESTADO DE PERNAMBUCO, BRASIL, EM INHAME

Authors

  • V. L. Lira 1 Programa de Pós-graduação em Saúde Humana e Meio Ambiente, Universidade Federal de Pernambuco – Centro Acadêmico de Vitória. Alto do Reservatório, s/n. Vitória de Santo Antão – PE – CEP. 55.608-680, Brasil; 2 Laboratório de Microbiologia e Imunologia, Universidade Federal de Pernambuco – Centro Acadêmico de Vitória. Alto do Reservatório, s/n. Vitória de Santo Antão – PE – CEP. 55.608-680, Brasil
  • M. O. Rosa Instituto Biológico, Caixa Postal 70, 13001-970 Campinas (SP), Brasil
  • S. A. de Oliveira Instituto Biológico, Caixa Postal 70, 13001-970 Campinas (SP), Brasil
  • C. M. G. de Oliveira Instituto Biológico, Caixa Postal 70, 13001-970 Campinas (SP), Brasil
  • R. M. de Moura 1 Programa de Pós-graduação em Saúde Humana e Meio Ambiente, Universidade Federal de Pernambuco – Centro Acadêmico de Vitória. Alto do Reservatório, s/n. Vitória de Santo Antão – PE – CEP. 55.608-680, Brasil; 2 Laboratório de Microbiologia e Imunologia, Universidade Federal de Pernambuco – Centro Acadêmico de Vitória. Alto do Reservatório, s/n. Vitória de Santo Antão – PE – CEP. 55.608-680, Brasil

Keywords:

DNA barcode, identification, root-lesion nematodes, sequencing. código de barras, identificação, sequenciamento, nematoide das lesões

Abstract

The coffee root-lesion nematode, Pratylenchus coffeae, is an important pathogen in several countries. A number of authors have questioned the taxonomic status of this group, suggesting the existence of different races or species in the taxon currently named P. coffeae. The objective of the present study was to characterize 10 putative P. coffeaepopulations that were collected from yam tubers (Dioscorea cayennensis) in Pernambuco State, Brazil, genetically using sequencing of D2/D3 region from 28S rDNA, and morphologically using light microscopy. Additionally, DNA barcode technology and specific primers were used in this study to demonstrate the utility of these techniques for the diagnosis of the P. coffeaepopulations studied. Based on morphological taxonomic studies, the following characteristics were observed: labial region with two distinct annuli, female tail terminus hemispherical, oval and functional spermatheca, and the presence of males. The specimens from the 10 populations that were included in the morphometric analysis showed high similarity to P. coffeae. According with the molecular analyses, it was concluded that all populations are P. coffeae since they showed high homology level (100%) with an isolate of this species deposited in the GenBank. In the same manner, diagnosis using specific primers confirmed the populations as P. coffeae, justifying and validating the utility of these molecular tools in the identification of nematode species.

O nematoide das lesões radiculares do cafeeiro, Pratylenchus coffeae, é considerado um patógeno importante e limitante à produção de diversas culturas em muitos países. Entretanto, vários autores têm questionado a posição taxonômica desse grupo de nematoides, sugerindo a possibilidade da existência de diferentes raças ou espécies no grupamento taxonômico atualmente chamado P. coffeae. Dessa forma, o principal objetivo do presente estudo foi caracterizar geneticamente populações de P. coffeae, coletadas em túberas de inhame (Dioscorea cayennensis) no Estado de Pernambuco, Brasil, através do sequenciamento da expansão D2/D3 da região 28S rDNA e realizar estudos morfológicos e morfométricos utilizando-se técnicas de microscopia de luz. Além disso, utilizou-se no presente estudo a metodologia de diagnose das populações de P. coffeaepela aplicação da tecnologia do código de barras do DNA e primers específicos, com o objetivo de demonstrar a utilidade dessas técnicas para a diagnose das 10 populações de P. coffeaeestudadas. Com base nos estudos taxonômicos morfológicos dessas populações, observaram-se as seguintes características: região labial com dois anéis distintos, ponta da cauda da fêmea hemisférica, espermateca oval, funcional e presença de machos. Os valores das características morfométricas de todas as populações estudadas foram semelhantes a P. coffeae. De acordo com as análises moleculares, concluiu-se que todas as populações, através da comparação das sequências com outras presentes no banco de dados GenBank, tratam-se de P. coffeae, uma vez que apresentaram alto grau de homologia (100%) com um isolado dessa espécie. Da mesma forma, a diagnose de P. coffeaefoi confirmada pelo uso de primers específicos, justificando e validando a aplicação dessas técnicas molecularesna identificação de espécies de nematoides.

Downloads

Published

2014-02-01