TRANSCRIPTOME AND PROTEOME ALTERATIONS DURING THE NEMATODE-SOYBEAN INTERACTION

Abstract

Plant-parasitic nematodes are important pests that cause an estimated worldwide loss of $100 billion annually. The root-knot and cyst nematodes are of major economic importance to soybean. Consequently, the need for comprehensive understanding of these nematodes directs researchers to combine the transcriptome and proteome analyses to determine the interplay between alterations in soybean gene expression and nematode parasitism. Microarray studies have found several thousand alterations in transcript abundance during nematode parasitism; proteomics has allowed analysis of thousands of root and nematode proteins. The current knowledge of root-nematode interactions is mostly based on transcriptomic data with few proteomic studies. The root-knot and soybean cyst nematode proteins are the topic of this review because they play an important role in manipulation of soybean root cell biology. A better understanding of these proteins and the altered soybean proteins in response to nematode parasitism would help in the discovery of new nematode resistance targets.

Los nematodos parásitos de plantas son importantes plagas de los cultivos que causan unas pérdidas anuales estimadas en $100 billones a nivel mundial. Los nematodos formadores de agallas en las raíces y los quísticos tienen además, una gran importancia económica en el cultivo de la soja. Consecuentemente, existe la necesidad de un conocimiento profundo sobre estos nematodos que conduce a los investigadores a combinar análisis trascriptómicos y proteómicos que permitan determinar la relación entre alteraciones en la expresión génica de la soja y el parasitismo del nematodo. Estudios por micromatrices han encontrado miles de alteraciones en la abundancia de transcritos durante el parasitismo por nematodos; la proteómica ha permitido el análisis de miles de proteínas de las raíces y de los nematodos. El conocimiento actual sobre las interacciones raíz-nematodo se basa principalmente en datos transcriptómicos con unos pocos estudios proteómicos. Las proteínas de nematodos agalladores de raíces y del nematodo quístico de la soja constituyen el tema de esta revisión, debido a que juegan un papel importante en la manipulación de la biología celular de la raíz de soja. Un mejor conocimiento de estas proteínas y de las proteínas de soja alteradas en respuesta al parasitismo por los nematodos podría ayudar en el descubrimiento de nuevos objetivos para la resistencia a nematodos.